Ankara Cumhuriyet Başsavcılığı’nın kararında “İhbarda bulunanın misyon yaptığı Hazine Müsteşarlığı’ndaki misyon değişikliği ve hakkında idari soruşturma yapılmış olmasına karşı yönetim hukuku unsurlarına nazaran yasal yollara başvurulabileceği, Cumhuryet Başsavcılığımızın dairenin süreçlerine yerindelik kontrol yapmak üzere yetki ve misyon bulunmadığı, kurum içersinde vazifeyle ilgili disiplin ve idari tasarrufta bulunan yetkililerin bu tasarrufundan ötürü rastgele bir silahlı terör örgütüyle illiyet ve irtbatının kurulamayacağı belge kapsamında anlaşılmıştır” denildi. Bu nedenle Ali Babacan ve öteki Hazine Müsteşarlığı vazifelileri hakkında soruşturma yapılmasına yer olmadığı vurgulandı.
Ali Çevik isimli eski Hazine çalışanı Ali Babacan hakkında kabahat duyurusunda bulunup, bakanlık yaptığı periyotlarda bürokratik atamalarda ve İzmir Askeri Casusluk Davası kumpası Hazine Müsteşarlığı’nda hayata geçirilmesinde FETÖ’ye bilerek ve isteyerek yardım ettiğini öne sürmüştü. Babacan’ın yanına danışman olarak aldığı herkesin FETÖ’cü çıktığı sav edilen müracaatta isimleri İzmir’deki askeri casusluk davasına misyondan uzaklaştırılıp, yerlerine FETÖ’cüleri almakla suçlamıştı. Babacan’ın bu biçimde örgüte yardım ettiği sav edilmiş ve Hazine’de kritik misyonlara atadığı isimlerin bir kısmının da Ankara’daki yargılama sonucu mahkum olduğu söz edilmişti.